一家化工企业因为土地问题被人举报。企业使用的土地并不是偷偷占来的，其中 40 亩土地，是通过协议方式取得的，而且企业已经办理了土地证；另外 10 亩土地，则是向村委会租赁使用，企业一直按照约定支付租金。公司认为土地有来源、手续有文件、租赁有合同、费用也一直在交，怎么可能是违法占地？但真正麻烦的地方恰恰在这里。有人向国土部门举报企业存在违法占地问题后，行政机关开始调查企业实际占地情况。调查过程中，行政机关确认企业实际占地 54 亩，同时认为企业部分用地手续存在问题。更值得企业警惕的是，行政机关并没有因为企业手里有协议、有土地证、有租赁关系，就直接认可全部用地合法，而是继续对企业用地手续进行调查处理。之后，行政机关又对企业作出了行政处罚。